Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc27Q3V036 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc27Q3V036 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc27Q3V036 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc27Q3V036 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc27Q3V036 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc27Q3V036 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc27Q3V036 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc27Q3V036 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc27Q3V036 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc27Q3V036 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc27Q3V036 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc27Q3V036 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc27Q3V036 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc27Q3V036 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc27Q3V036 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc27Q3V036 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc27Q3V036 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc27Q3V036 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc27Q3V036 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc27Q3V036 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc27Q3V036 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc27Q3V036 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc27Q3V036 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc27Q3V036 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc27Q3V036 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc27Q3V036 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc27Q3V036 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc27Q3V036 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc27Q3V036 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc27Q3V036 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc27Q3V036 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc27Q3V036 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc27Q3V036 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc27Q3V036 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc27Q3V036 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc27Q3V036 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc27Q3V036 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc27Q3V036 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc27Q3V036 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc27Q3V036 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc27Q3V036 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc27Q3V036 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc27Q3V036 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc27Q3V036 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc27Q3V036 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc27Q3V036 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc27Q3V036 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc27Q3V036 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc27Q3V036 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc27Q3V036 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc27Q3V036 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc27Q3V036 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc27Q3V036 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc27Q3V036 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc27Q3V036 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc27Q3V036 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc27Q3V036 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc27Q3V036 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.2 ms