Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnpc3Q3UZ01 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnpc3Q3UZ01 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnpc3Q3UZ01 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnpc3Q3UZ01 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnpc3Q3UZ01 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnpc3Q3UZ01 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnpc3Q3UZ01 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnpc3Q3UZ01 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnpc3Q3UZ01 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnpc3Q3UZ01 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnpc3Q3UZ01 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnpc3Q3UZ01 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnpc3Q3UZ01 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnpc3Q3UZ01 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnpc3Q3UZ01 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnpc3Q3UZ01 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnpc3Q3UZ01 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnpc3Q3UZ01 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnpc3Q3UZ01 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnpc3Q3UZ01 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnpc3Q3UZ01 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnpc3Q3UZ01 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnpc3Q3UZ01 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnpc3Q3UZ01 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnpc3Q3UZ01 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnpc3Q3UZ01 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnpc3Q3UZ01 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnpc3Q3UZ01 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnpc3Q3UZ01 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnpc3Q3UZ01 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnpc3Q3UZ01 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnpc3Q3UZ01 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnpc3Q3UZ01 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnpc3Q3UZ01 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnpc3Q3UZ01 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnpc3Q3UZ01 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnpc3Q3UZ01 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnpc3Q3UZ01 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnpc3Q3UZ01 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnpc3Q3UZ01 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnpc3Q3UZ01 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnpc3Q3UZ01 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnpc3Q3UZ01 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rnpc3Q3UZ01 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnpc3Q3UZ01 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms