Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Skap1Q3UUV5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skap1Q3UUV5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms