Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rmdn3Q3UJU9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rmdn3Q3UJU9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rmdn3Q3UJU9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms