Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGK8

Gm5113, Predicted gene 5113, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5113Q3UGK8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm5113Q3UGK8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm5113Q3UGK8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm5113Q3UGK8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm5113Q3UGK8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm5113Q3UGK8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm5113Q3UGK8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm5113Q3UGK8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm5113Q3UGK8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm5113Q3UGK8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm5113Q3UGK8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm5113Q3UGK8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm5113Q3UGK8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm5113Q3UGK8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm5113Q3UGK8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm5113Q3UGK8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm5113Q3UGK8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm5113Q3UGK8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm5113Q3UGK8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm5113Q3UGK8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm5113Q3UGK8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm5113Q3UGK8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm5113Q3UGK8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5113Q3UGK8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5113Q3UGK8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5113Q3UGK8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5113Q3UGK8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5113Q3UGK8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5113Q3UGK8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5113Q3UGK8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5113Q3UGK8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5113Q3UGK8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5113Q3UGK8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5113Q3UGK8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5113Q3UGK8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5113Q3UGK8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5113Q3UGK8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5113Q3UGK8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5113Q3UGK8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms