Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNH5

Fam172a, Protein FAM172A, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam172aQ3TNH5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam172aQ3TNH5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam172aQ3TNH5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam172aQ3TNH5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam172aQ3TNH5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam172aQ3TNH5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam172aQ3TNH5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam172aQ3TNH5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam172aQ3TNH5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam172aQ3TNH5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam172aQ3TNH5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam172aQ3TNH5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam172aQ3TNH5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam172aQ3TNH5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam172aQ3TNH5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam172aQ3TNH5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam172aQ3TNH5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam172aQ3TNH5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam172aQ3TNH5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam172aQ3TNH5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam172aQ3TNH5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam172aQ3TNH5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam172aQ3TNH5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam172aQ3TNH5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam172aQ3TNH5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam172aQ3TNH5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fam172aQ3TNH5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fam172aQ3TNH5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fam172aQ3TNH5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fam172aQ3TNH5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam172aQ3TNH5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms