Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ascl1Q02067 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ascl1Q02067 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149 ms