Protein–RNA interactions for Protein: P97770

Thumpd3, THUMP domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd3P97770 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Thumpd3P97770 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Thumpd3P97770 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Thumpd3P97770 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Thumpd3P97770 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Thumpd3P97770 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Thumpd3P97770 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Thumpd3P97770 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Thumpd3P97770 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Thumpd3P97770 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Thumpd3P97770 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Thumpd3P97770 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Thumpd3P97770 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Thumpd3P97770 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Thumpd3P97770 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Thumpd3P97770 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Thumpd3P97770 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Thumpd3P97770 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Thumpd3P97770 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Thumpd3P97770 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Thumpd3P97770 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Thumpd3P97770 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Thumpd3P97770 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Thumpd3P97770 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Thumpd3P97770 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Thumpd3P97770 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Thumpd3P97770 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Thumpd3P97770 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Thumpd3P97770 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Thumpd3P97770 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Thumpd3P97770 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Thumpd3P97770 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Thumpd3P97770 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Thumpd3P97770 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Thumpd3P97770 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Thumpd3P97770 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Thumpd3P97770 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Thumpd3P97770 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Thumpd3P97770 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Thumpd3P97770 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms