Protein–RNA interactions for Protein: P60603

Romo1, Reactive oxygen species modulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Romo1P60603 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Romo1P60603 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Romo1P60603 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Romo1P60603 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Romo1P60603 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Romo1P60603 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Romo1P60603 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Romo1P60603 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Romo1P60603 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Romo1P60603 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Romo1P60603 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Romo1P60603 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Romo1P60603 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Romo1P60603 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Romo1P60603 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Romo1P60603 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Romo1P60603 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Romo1P60603 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Romo1P60603 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Romo1P60603 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Romo1P60603 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Romo1P60603 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Romo1P60603 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Romo1P60603 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Romo1P60603 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Romo1P60603 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.3 ms