Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pcmtd1P59913 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcmtd1P59913 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcmtd1P59913 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms