Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bace1P56818 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bace1P56818 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bace1P56818 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bace1P56818 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bace1P56818 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bace1P56818 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bace1P56818 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bace1P56818 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bace1P56818 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bace1P56818 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Bace1P56818 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bace1P56818 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bace1P56818 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bace1P56818 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bace1P56818 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bace1P56818 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bace1P56818 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bace1P56818 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bace1P56818 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bace1P56818 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bace1P56818 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bace1P56818 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bace1P56818 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bace1P56818 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bace1P56818 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bace1P56818 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bace1P56818 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bace1P56818 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Bace1P56818 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bace1P56818 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bace1P56818 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bace1P56818 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bace1P56818 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bace1P56818 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bace1P56818 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bace1P56818 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bace1P56818 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bace1P56818 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bace1P56818 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bace1P56818 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Bace1P56818 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bace1P56818 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bace1P56818 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bace1P56818 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bace1P56818 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bace1P56818 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bace1P56818 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bace1P56818 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bace1P56818 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bace1P56818 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bace1P56818 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bace1P56818 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bace1P56818 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bace1P56818 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bace1P56818 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bace1P56818 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bace1P56818 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bace1P56818 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Bace1P56818 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bace1P56818 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bace1P56818 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bace1P56818 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bace1P56818 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bace1P56818 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bace1P56818 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bace1P56818 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bace1P56818 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bace1P56818 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bace1P56818 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bace1P56818 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bace1P56818 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bace1P56818 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bace1P56818 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bace1P56818 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bace1P56818 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bace1P56818 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bace1P56818 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bace1P56818 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bace1P56818 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bace1P56818 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bace1P56818 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bace1P56818 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bace1P56818 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bace1P56818 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Bace1P56818 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bace1P56818 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bace1P56818 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bace1P56818 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bace1P56818 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Bace1P56818 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bace1P56818 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bace1P56818 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bace1P56818 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bace1P56818 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms