Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Upp1P52624 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Upp1P52624 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Upp1P52624 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Upp1P52624 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Upp1P52624 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Upp1P52624 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Upp1P52624 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Upp1P52624 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Upp1P52624 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Upp1P52624 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Upp1P52624 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Upp1P52624 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Upp1P52624 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Upp1P52624 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Upp1P52624 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Upp1P52624 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Upp1P52624 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Upp1P52624 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Upp1P52624 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Upp1P52624 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Upp1P52624 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Upp1P52624 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.4 ms