Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmod1P49813 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmod1P49813 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms