Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psen1P49769 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psen1P49769 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Psen1P49769 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Psen1P49769 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Psen1P49769 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psen1P49769 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Psen1P49769 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Psen1P49769 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Psen1P49769 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Psen1P49769 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psen1P49769 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psen1P49769 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Psen1P49769 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms