Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Epb41P48193 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Epb41P48193 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Epb41P48193 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Epb41P48193 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Epb41P48193 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Epb41P48193 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Epb41P48193 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Epb41P48193 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Epb41P48193 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms