Protein–RNA interactions for Protein: P47753

Capza1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza1P47753 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capza1P47753 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Capza1P47753 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Capza1P47753 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capza1P47753 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Capza1P47753 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capza1P47753 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capza1P47753 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capza1P47753 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capza1P47753 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capza1P47753 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms