Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd8P23463 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd8P23463 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd8P23463 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd8P23463 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Hoxd8P23463 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd8P23463 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd8P23463 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd8P23463 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd8P23463 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd8P23463 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd8P23463 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxd8P23463 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxd8P23463 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxd8P23463 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxd8P23463 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxd8P23463 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxd8P23463 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxd8P23463 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd8P23463 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd8P23463 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms