Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtpraP18052 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtpraP18052 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtpraP18052 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtpraP18052 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtpraP18052 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtpraP18052 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtpraP18052 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PtpraP18052 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PtpraP18052 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtpraP18052 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtpraP18052 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtpraP18052 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtpraP18052 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtpraP18052 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtpraP18052 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtpraP18052 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtpraP18052 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtpraP18052 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtpraP18052 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtpraP18052 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PtpraP18052 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtpraP18052 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtpraP18052 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtpraP18052 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtpraP18052 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtpraP18052 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtpraP18052 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtpraP18052 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtpraP18052 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtpraP18052 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtpraP18052 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtpraP18052 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtpraP18052 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtpraP18052 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtpraP18052 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtpraP18052 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtpraP18052 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtpraP18052 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtpraP18052 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtpraP18052 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtpraP18052 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtpraP18052 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtpraP18052 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PtpraP18052 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtpraP18052 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtpraP18052 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtpraP18052 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtpraP18052 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtpraP18052 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtpraP18052 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtpraP18052 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtpraP18052 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms