Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Pou4f1P17208 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
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Pou4f1P17208 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pou4f1P17208 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms