Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabra6P16305 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabra6P16305 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabra6P16305 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gabra6P16305 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabra6P16305 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabra6P16305 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabra6P16305 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabra6P16305 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra6P16305 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra6P16305 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra6P16305 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra6P16305 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra6P16305 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra6P16305 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra6P16305 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra6P16305 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra6P16305 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra6P16305 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra6P16305 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra6P16305 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra6P16305 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra6P16305 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra6P16305 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra6P16305 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra6P16305 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms