Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FlgP11088 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FlgP11088 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FlgP11088 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FlgP11088 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FlgP11088 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FlgP11088 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FlgP11088 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FlgP11088 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FlgP11088 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FlgP11088 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FlgP11088 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FlgP11088 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FlgP11088 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FlgP11088 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FlgP11088 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FlgP11088 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FlgP11088 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FlgP11088 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FlgP11088 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FlgP11088 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FlgP11088 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FlgP11088 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FlgP11088 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FlgP11088 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FlgP11088 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FlgP11088 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FlgP11088 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FlgP11088 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FlgP11088 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FlgP11088 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FlgP11088 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FlgP11088 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FlgP11088 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FlgP11088 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FlgP11088 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FlgP11088 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FlgP11088 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FlgP11088 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FlgP11088 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FlgP11088 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FlgP11088 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FlgP11088 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FlgP11088 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FlgP11088 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FlgP11088 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FlgP11088 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FlgP11088 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FlgP11088 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FlgP11088 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FlgP11088 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FlgP11088 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FlgP11088 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FlgP11088 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FlgP11088 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FlgP11088 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FlgP11088 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FlgP11088 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FlgP11088 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FlgP11088 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FlgP11088 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FlgP11088 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FlgP11088 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FlgP11088 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FlgP11088 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FlgP11088 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FlgP11088 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FlgP11088 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FlgP11088 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FlgP11088 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FlgP11088 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FlgP11088 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FlgP11088 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FlgP11088 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FlgP11088 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FlgP11088 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FlgP11088 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FlgP11088 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FlgP11088 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FlgP11088 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FlgP11088 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FlgP11088 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FlgP11088 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FlgP11088 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FlgP11088 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FlgP11088 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FlgP11088 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FlgP11088 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FlgP11088 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FlgP11088 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FlgP11088 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FlgP11088 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FlgP11088 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FlgP11088 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FlgP11088 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FlgP11088 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FlgP11088 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FlgP11088 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FlgP11088 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FlgP11088 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms