Protein–RNA interactions for Protein: P02772

Afp, Alpha-fetoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AfpP02772 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AfpP02772 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AfpP02772 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AfpP02772 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AfpP02772 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AfpP02772 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AfpP02772 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AfpP02772 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AfpP02772 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AfpP02772 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AfpP02772 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AfpP02772 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AfpP02772 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AfpP02772 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AfpP02772 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AfpP02772 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AfpP02772 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AfpP02772 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AfpP02772 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AfpP02772 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AfpP02772 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AfpP02772 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AfpP02772 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AfpP02772 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AfpP02772 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AfpP02772 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AfpP02772 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AfpP02772 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AfpP02772 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AfpP02772 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AfpP02772 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AfpP02772 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
AfpP02772 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AfpP02772 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AfpP02772 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AfpP02772 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AfpP02772 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AfpP02772 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.31■■□□□ 1
AfpP02772 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AfpP02772 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AfpP02772 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AfpP02772 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AfpP02772 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AfpP02772 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AfpP02772 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AfpP02772 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AfpP02772 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AfpP02772 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AfpP02772 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AfpP02772 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
AfpP02772 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AfpP02772 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AfpP02772 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AfpP02772 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AfpP02772 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AfpP02772 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AfpP02772 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AfpP02772 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AfpP02772 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
AfpP02772 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AfpP02772 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AfpP02772 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AfpP02772 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AfpP02772 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AfpP02772 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AfpP02772 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AfpP02772 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AfpP02772 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AfpP02772 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AfpP02772 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AfpP02772 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AfpP02772 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AfpP02772 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AfpP02772 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AfpP02772 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AfpP02772 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AfpP02772 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AfpP02772 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AfpP02772 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AfpP02772 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AfpP02772 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AfpP02772 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AfpP02772 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AfpP02772 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AfpP02772 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AfpP02772 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AfpP02772 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AfpP02772 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AfpP02772 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AfpP02772 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AfpP02772 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AfpP02772 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AfpP02772 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AfpP02772 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AfpP02772 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AfpP02772 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AfpP02772 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AfpP02772 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AfpP02772 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AfpP02772 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms