Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IfnabL7MTU6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms