Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Ccdc180J3QNE4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Ccdc180J3QNE4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Ccdc180J3QNE4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Ccdc180J3QNE4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Ccdc180J3QNE4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Ccdc180J3QNE4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Ccdc180J3QNE4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Ccdc180J3QNE4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Ccdc180J3QNE4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Ccdc180J3QNE4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Ccdc180J3QNE4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Ccdc180J3QNE4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Ccdc180J3QNE4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Ccdc180J3QNE4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Ccdc180J3QNE4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Ccdc180J3QNE4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Ccdc180J3QNE4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Ccdc180J3QNE4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Ccdc180J3QNE4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Ccdc180J3QNE4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Ccdc180J3QNE4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Ccdc180J3QNE4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Ccdc180J3QNE4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Ccdc180J3QNE4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Ccdc180J3QNE4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Ccdc180J3QNE4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Ccdc180J3QNE4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Ccdc180J3QNE4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Ccdc180J3QNE4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Ccdc180J3QNE4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Ccdc180J3QNE4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Ccdc180J3QNE4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Ccdc180J3QNE4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Ccdc180J3QNE4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Ccdc180J3QNE4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Ccdc180J3QNE4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Ccdc180J3QNE4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Ccdc180J3QNE4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Ccdc180J3QNE4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
Ccdc180J3QNE4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC37.63■■■■□ 3.62
Ccdc180J3QNE4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Ccdc180J3QNE4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Ccdc180J3QNE4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Ccdc180J3QNE4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Ccdc180J3QNE4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Ccdc180J3QNE4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Ccdc180J3QNE4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Ccdc180J3QNE4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Ccdc180J3QNE4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
Ccdc180J3QNE4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Ccdc180J3QNE4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Ccdc180J3QNE4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Ccdc180J3QNE4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Ccdc180J3QNE4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Ccdc180J3QNE4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Ccdc180J3QNE4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Ccdc180J3QNE4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
Ccdc180J3QNE4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Ccdc180J3QNE4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Ccdc180J3QNE4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Ccdc180J3QNE4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Ccdc180J3QNE4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Ccdc180J3QNE4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Ccdc180J3QNE4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Ccdc180J3QNE4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Ccdc180J3QNE4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Ccdc180J3QNE4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
Ccdc180J3QNE4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Ccdc180J3QNE4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Ccdc180J3QNE4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Ccdc180J3QNE4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Ccdc180J3QNE4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Ccdc180J3QNE4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Ccdc180J3QNE4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Ccdc180J3QNE4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Ccdc180J3QNE4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Ccdc180J3QNE4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Ccdc180J3QNE4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Ccdc180J3QNE4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Ccdc180J3QNE4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Ccdc180J3QNE4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Ccdc180J3QNE4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Ccdc180J3QNE4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Ccdc180J3QNE4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Ccdc180J3QNE4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Ccdc180J3QNE4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Ccdc180J3QNE4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Ccdc180J3QNE4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Ccdc180J3QNE4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Ccdc180J3QNE4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Ccdc180J3QNE4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Ccdc180J3QNE4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Ccdc180J3QNE4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Ccdc180J3QNE4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Ccdc180J3QNE4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Ccdc180J3QNE4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Ccdc180J3QNE4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Ccdc180J3QNE4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Ccdc180J3QNE4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms