Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm11236J3QMS7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm11236J3QMS7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm11236J3QMS7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm11236J3QMS7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm11236J3QMS7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm11236J3QMS7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm11236J3QMS7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm11236J3QMS7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm11236J3QMS7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm11236J3QMS7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm11236J3QMS7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm11236J3QMS7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm11236J3QMS7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 757.5 ms