Protein–RNA interactions for Protein: J3QMM6

Gm21746, Predicted gene, 21746, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21746J3QMM6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm21746J3QMM6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Gm21746J3QMM6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21746J3QMM6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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