Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
J3KRW8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
J3KRW8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
J3KRW8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
J3KRW8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
J3KRW8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
J3KRW8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
J3KRW8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
J3KRW8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
J3KRW8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
J3KRW8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
J3KRW8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
J3KRW8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
J3KRW8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
J3KRW8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
J3KRW8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
J3KRW8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
J3KRW8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
J3KRW8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
J3KRW8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
J3KRW8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
J3KRW8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
J3KRW8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
J3KRW8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
J3KRW8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
J3KRW8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
J3KRW8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
J3KRW8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
J3KRW8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
J3KRW8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
J3KRW8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
J3KRW8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
J3KRW8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
J3KRW8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
J3KRW8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
J3KRW8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
J3KRW8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
J3KRW8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
J3KRW8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
J3KRW8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
J3KRW8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
J3KRW8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
J3KRW8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
J3KRW8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
J3KRW8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
J3KRW8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
J3KRW8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
J3KRW8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
J3KRW8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
J3KRW8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
J3KRW8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
J3KRW8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
J3KRW8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
J3KRW8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
J3KRW8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
J3KRW8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
J3KRW8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
J3KRW8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
J3KRW8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
J3KRW8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
J3KRW8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
J3KRW8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
J3KRW8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
J3KRW8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
J3KRW8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
J3KRW8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
J3KRW8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
J3KRW8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
J3KRW8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
J3KRW8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17■□□□□ 0.31
J3KRW8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
J3KRW8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
J3KRW8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
J3KRW8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
J3KRW8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
J3KRW8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
J3KRW8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
J3KRW8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
J3KRW8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
J3KRW8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
J3KRW8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
J3KRW8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
J3KRW8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
J3KRW8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
J3KRW8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
J3KRW8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3KRW8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3KRW8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3KRW8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3KRW8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3KRW8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3KRW8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3KRW8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3KRW8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3KRW8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3KRW8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3KRW8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3KRW8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3KRW8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3KRW8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms