Protein–RNA interactions for Protein: J3JS27

Vmn1r194, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r194J3JS27 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r194J3JS27 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r194J3JS27 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms