Protein–RNA interactions for Protein: G8JL69

Gm11027, Predicted gene 11027, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11027G8JL69 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11027G8JL69 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11027G8JL69 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11027G8JL69 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11027G8JL69 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11027G8JL69 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11027G8JL69 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11027G8JL69 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11027G8JL69 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11027G8JL69 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11027G8JL69 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11027G8JL69 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11027G8JL69 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11027G8JL69 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11027G8JL69 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11027G8JL69 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11027G8JL69 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11027G8JL69 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11027G8JL69 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11027G8JL69 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11027G8JL69 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11027G8JL69 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11027G8JL69 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11027G8JL69 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11027G8JL69 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11027G8JL69 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11027G8JL69 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11027G8JL69 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11027G8JL69 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11027G8JL69 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11027G8JL69 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm11027G8JL69 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm11027G8JL69 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm11027G8JL69 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm11027G8JL69 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm11027G8JL69 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm11027G8JL69 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm11027G8JL69 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms