Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rfx7F8VPJ6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rfx7F8VPJ6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rfx7F8VPJ6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rfx7F8VPJ6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rfx7F8VPJ6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rfx7F8VPJ6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rfx7F8VPJ6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rfx7F8VPJ6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rfx7F8VPJ6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rfx7F8VPJ6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rfx7F8VPJ6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rfx7F8VPJ6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rfx7F8VPJ6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rfx7F8VPJ6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rfx7F8VPJ6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rfx7F8VPJ6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rfx7F8VPJ6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rfx7F8VPJ6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rfx7F8VPJ6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rfx7F8VPJ6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rfx7F8VPJ6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rfx7F8VPJ6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rfx7F8VPJ6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rfx7F8VPJ6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rfx7F8VPJ6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rfx7F8VPJ6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rfx7F8VPJ6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rfx7F8VPJ6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rfx7F8VPJ6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Rfx7F8VPJ6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rfx7F8VPJ6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rfx7F8VPJ6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rfx7F8VPJ6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rfx7F8VPJ6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rfx7F8VPJ6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rfx7F8VPJ6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rfx7F8VPJ6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rfx7F8VPJ6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rfx7F8VPJ6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rfx7F8VPJ6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rfx7F8VPJ6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rfx7F8VPJ6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rfx7F8VPJ6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rfx7F8VPJ6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rfx7F8VPJ6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rfx7F8VPJ6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rfx7F8VPJ6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rfx7F8VPJ6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rfx7F8VPJ6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rfx7F8VPJ6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Rfx7F8VPJ6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rfx7F8VPJ6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rfx7F8VPJ6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rfx7F8VPJ6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rfx7F8VPJ6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rfx7F8VPJ6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rfx7F8VPJ6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Rfx7F8VPJ6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rfx7F8VPJ6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rfx7F8VPJ6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rfx7F8VPJ6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rfx7F8VPJ6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rfx7F8VPJ6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rfx7F8VPJ6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rfx7F8VPJ6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rfx7F8VPJ6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rfx7F8VPJ6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rfx7F8VPJ6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rfx7F8VPJ6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rfx7F8VPJ6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rfx7F8VPJ6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rfx7F8VPJ6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rfx7F8VPJ6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rfx7F8VPJ6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Rfx7F8VPJ6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rfx7F8VPJ6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rfx7F8VPJ6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rfx7F8VPJ6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rfx7F8VPJ6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rfx7F8VPJ6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rfx7F8VPJ6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Rfx7F8VPJ6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rfx7F8VPJ6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rfx7F8VPJ6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Rfx7F8VPJ6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rfx7F8VPJ6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rfx7F8VPJ6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rfx7F8VPJ6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rfx7F8VPJ6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rfx7F8VPJ6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rfx7F8VPJ6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rfx7F8VPJ6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rfx7F8VPJ6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rfx7F8VPJ6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rfx7F8VPJ6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rfx7F8VPJ6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rfx7F8VPJ6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rfx7F8VPJ6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Rfx7F8VPJ6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.6 ms