Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r68E9Q0V3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vmn1r68E9Q0V3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms