Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Trappc8E9PWG2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Trappc8E9PWG2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Trappc8E9PWG2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Trappc8E9PWG2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Trappc8E9PWG2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Trappc8E9PWG2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Trappc8E9PWG2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Trappc8E9PWG2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Trappc8E9PWG2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Trappc8E9PWG2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Trappc8E9PWG2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Trappc8E9PWG2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Trappc8E9PWG2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Trappc8E9PWG2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Trappc8E9PWG2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Trappc8E9PWG2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Trappc8E9PWG2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Trappc8E9PWG2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Trappc8E9PWG2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Trappc8E9PWG2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Trappc8E9PWG2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Trappc8E9PWG2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Trappc8E9PWG2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Trappc8E9PWG2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Trappc8E9PWG2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Trappc8E9PWG2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Trappc8E9PWG2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Trappc8E9PWG2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Trappc8E9PWG2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Trappc8E9PWG2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Trappc8E9PWG2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Trappc8E9PWG2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Trappc8E9PWG2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Trappc8E9PWG2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Trappc8E9PWG2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Trappc8E9PWG2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Trappc8E9PWG2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Trappc8E9PWG2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Trappc8E9PWG2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Trappc8E9PWG2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Trappc8E9PWG2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Trappc8E9PWG2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Trappc8E9PWG2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Trappc8E9PWG2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Trappc8E9PWG2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Trappc8E9PWG2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Trappc8E9PWG2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Trappc8E9PWG2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Trappc8E9PWG2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Trappc8E9PWG2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Trappc8E9PWG2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Trappc8E9PWG2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Trappc8E9PWG2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Trappc8E9PWG2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms