Protein–RNA interactions for Protein: D3Z291

Calhm1, Calcium homeostasis modulator protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm1D3Z291 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calhm1D3Z291 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Calhm1D3Z291 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calhm1D3Z291 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calhm1D3Z291 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calhm1D3Z291 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calhm1D3Z291 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calhm1D3Z291 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calhm1D3Z291 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calhm1D3Z291 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calhm1D3Z291 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calhm1D3Z291 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calhm1D3Z291 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calhm1D3Z291 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calhm1D3Z291 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calhm1D3Z291 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Calhm1D3Z291 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calhm1D3Z291 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Calhm1D3Z291 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calhm1D3Z291 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calhm1D3Z291 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calhm1D3Z291 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calhm1D3Z291 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calhm1D3Z291 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calhm1D3Z291 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calhm1D3Z291 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calhm1D3Z291 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Calhm1D3Z291 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Calhm1D3Z291 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Calhm1D3Z291 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Calhm1D3Z291 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Calhm1D3Z291 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Calhm1D3Z291 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Calhm1D3Z291 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Calhm1D3Z291 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Calhm1D3Z291 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Calhm1D3Z291 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms