Protein–RNA interactions for Protein: A3KG59

Pm20d2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d2A3KG59 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pm20d2A3KG59 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pm20d2A3KG59 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms