Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Gm6880A3KG45 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Gm6880A3KG45 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm6880A3KG45 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Gm6880A3KG45 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Gm6880A3KG45 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Gm6880A3KG45 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm6880A3KG45 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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