Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E5

Atoh7, Protein atonal homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh7Q9Z2E5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atoh7Q9Z2E5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atoh7Q9Z2E5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atoh7Q9Z2E5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atoh7Q9Z2E5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atoh7Q9Z2E5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atoh7Q9Z2E5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atoh7Q9Z2E5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atoh7Q9Z2E5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atoh7Q9Z2E5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atoh7Q9Z2E5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atoh7Q9Z2E5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atoh7Q9Z2E5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atoh7Q9Z2E5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atoh7Q9Z2E5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atoh7Q9Z2E5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atoh7Q9Z2E5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atoh7Q9Z2E5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atoh7Q9Z2E5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atoh7Q9Z2E5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atoh7Q9Z2E5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atoh7Q9Z2E5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atoh7Q9Z2E5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atoh7Q9Z2E5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atoh7Q9Z2E5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atoh7Q9Z2E5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atoh7Q9Z2E5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atoh7Q9Z2E5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atoh7Q9Z2E5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atoh7Q9Z2E5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atoh7Q9Z2E5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atoh7Q9Z2E5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atoh7Q9Z2E5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atoh7Q9Z2E5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atoh7Q9Z2E5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atoh7Q9Z2E5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atoh7Q9Z2E5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atoh7Q9Z2E5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atoh7Q9Z2E5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atoh7Q9Z2E5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms