Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Shcbp1Q9Z179 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Shcbp1Q9Z179 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms