Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cited4Q9WUL8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cited4Q9WUL8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms