Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc2lQ9JME7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms