Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gkap1Q9JMB0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gkap1Q9JMB0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms