Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
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Bco1Q9JJS6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bco1Q9JJS6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bco1Q9JJS6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bco1Q9JJS6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bco1Q9JJS6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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Bco1Q9JJS6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bco1Q9JJS6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Bco1Q9JJS6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bco1Q9JJS6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Bco1Q9JJS6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Bco1Q9JJS6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Bco1Q9JJS6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bco1Q9JJS6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Bco1Q9JJS6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bco1Q9JJS6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bco1Q9JJS6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Bco1Q9JJS6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bco1Q9JJS6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bco1Q9JJS6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bco1Q9JJS6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bco1Q9JJS6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bco1Q9JJS6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bco1Q9JJS6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bco1Q9JJS6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bco1Q9JJS6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Bco1Q9JJS6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bco1Q9JJS6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bco1Q9JJS6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bco1Q9JJS6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bco1Q9JJS6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bco1Q9JJS6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bco1Q9JJS6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bco1Q9JJS6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bco1Q9JJS6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bco1Q9JJS6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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