Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Xab2Q9DCD2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xab2Q9DCD2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 213.3 ms