Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Klhl40Q9D783 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Klhl40Q9D783 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Klhl40Q9D783 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms