Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3N5

5430402E10Rik, RIKEN cDNA 5430402E10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430402E10RikQ9D3N5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
5430402E10RikQ9D3N5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
5430402E10RikQ9D3N5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
5430402E10RikQ9D3N5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
5430402E10RikQ9D3N5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
5430402E10RikQ9D3N5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
5430402E10RikQ9D3N5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
5430402E10RikQ9D3N5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
5430402E10RikQ9D3N5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
5430402E10RikQ9D3N5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
5430402E10RikQ9D3N5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
5430402E10RikQ9D3N5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
5430402E10RikQ9D3N5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
5430402E10RikQ9D3N5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
5430402E10RikQ9D3N5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
5430402E10RikQ9D3N5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
5430402E10RikQ9D3N5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
5430402E10RikQ9D3N5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
5430402E10RikQ9D3N5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
5430402E10RikQ9D3N5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
5430402E10RikQ9D3N5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
5430402E10RikQ9D3N5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
5430402E10RikQ9D3N5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
5430402E10RikQ9D3N5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
5430402E10RikQ9D3N5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
5430402E10RikQ9D3N5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
5430402E10RikQ9D3N5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
5430402E10RikQ9D3N5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
5430402E10RikQ9D3N5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
5430402E10RikQ9D3N5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
5430402E10RikQ9D3N5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.2 ms