Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pramef12Q9D2F1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramef12Q9D2F1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramef12Q9D2F1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramef12Q9D2F1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramef12Q9D2F1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramef12Q9D2F1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramef12Q9D2F1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramef12Q9D2F1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramef12Q9D2F1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramef12Q9D2F1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramef12Q9D2F1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramef12Q9D2F1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramef12Q9D2F1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramef12Q9D2F1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramef12Q9D2F1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramef12Q9D2F1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramef12Q9D2F1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramef12Q9D2F1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramef12Q9D2F1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramef12Q9D2F1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramef12Q9D2F1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramef12Q9D2F1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramef12Q9D2F1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramef12Q9D2F1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramef12Q9D2F1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramef12Q9D2F1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramef12Q9D2F1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramef12Q9D2F1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramef12Q9D2F1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramef12Q9D2F1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramef12Q9D2F1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramef12Q9D2F1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramef12Q9D2F1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramef12Q9D2F1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramef12Q9D2F1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramef12Q9D2F1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramef12Q9D2F1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms