Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nol3Q9D1X0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nol3Q9D1X0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms