Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Chordc1Q9D1P4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms