Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
4930553M12RikQ9CUH1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4930553M12RikQ9CUH1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms