Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS00

Cactin, Cactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CactinQ9CS00 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CactinQ9CS00 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CactinQ9CS00 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CactinQ9CS00 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CactinQ9CS00 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CactinQ9CS00 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CactinQ9CS00 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CactinQ9CS00 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CactinQ9CS00 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CactinQ9CS00 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CactinQ9CS00 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CactinQ9CS00 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CactinQ9CS00 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CactinQ9CS00 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CactinQ9CS00 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CactinQ9CS00 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CactinQ9CS00 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CactinQ9CS00 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CactinQ9CS00 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CactinQ9CS00 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CactinQ9CS00 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CactinQ9CS00 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CactinQ9CS00 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CactinQ9CS00 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CactinQ9CS00 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CactinQ9CS00 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CactinQ9CS00 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CactinQ9CS00 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CactinQ9CS00 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CactinQ9CS00 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CactinQ9CS00 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CactinQ9CS00 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CactinQ9CS00 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CactinQ9CS00 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CactinQ9CS00 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CactinQ9CS00 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CactinQ9CS00 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CactinQ9CS00 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CactinQ9CS00 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CactinQ9CS00 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CactinQ9CS00 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CactinQ9CS00 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CactinQ9CS00 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CactinQ9CS00 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CactinQ9CS00 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CactinQ9CS00 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CactinQ9CS00 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CactinQ9CS00 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CactinQ9CS00 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CactinQ9CS00 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CactinQ9CS00 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CactinQ9CS00 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms