Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trappc2Q9CQP2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc2Q9CQP2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc2Q9CQP2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms